Program Studi Sistem Informasi merupakan salah satu program studi di dalam lingkungan Fakultas Teknik dan Ilmu Komputer. Program studi ini telah ada semenjak berdirinya UNIKOM, dengan nomor keputusan dari Mendiknas : No. 126/D/2000. Saat ini Program Studi Sistem Informasi telah mendapat raihan akreditasi “UNGGUL” berdasarkan Keputusan LAM INFOKOM No. 001/SK/LAM-INFOKOM/AK/S/I/2024.
Program Studi Sistem Informasi Universitas Komputer Indonesia (UNIKOM) merupakan hasil pengembangan dari Program Studi Manajemen Informatika yang telah lebih dahulu berdiri dan berkontribusi dalam penyelenggaraan pendidikan di bidang teknologi informasi. Seiring dengan perkembangan ilmu pengetahuan, kebutuhan industri, serta tuntutan kompetensi lulusan yang semakin kompleks, Program Studi Manajemen Informatika kemudian bertransformasi menjadi Program Studi Sistem Informasi.
Perubahan ini dilakukan sebagai upaya peningkatan mutu akademik dan relevansi keilmuan, khususnya dalam mengintegrasikan aspek teknologi informasi dengan proses bisnis, manajemen, dan pengambilan keputusan organisasi. Melalui transformasi tersebut, Program Studi Sistem Informasi UNIKOM tidak hanya menitikberatkan pada penguasaan teknis, tetapi juga pada kemampuan analisis, perancangan, dan pengelolaan sistem informasi secara komprehensif.
Hingga saat ini, Program Studi Sistem Informasi UNIKOM terus beradaptasi dengan perkembangan teknologi digital dan kebutuhan pemangku kepentingan, dengan tetap menjunjung tinggi nilai-nilai akademik, profesionalisme, dan inovasi.